Project information
Simultaneous gene transcription and translation
- Project Identification
- GJ20-16013Y
- Project Period
- 1/2020 - 12/2022
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Junior projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
U prokaryot je nově přepsaná RNA okamžitě navázána na ribozomy a transkripce je tak přímo spřažena s translací. To je v přímém kontrastu s transkripcí a translací u eukaryot, kde jsou oba procesy odděleny jadernou membránou. Některé ds DNA viry se nicméně replikují v cytoplasmatických továrnách infikovaných eukaryotických buněk, což zvyšuje pravděpodobnost toho, že by transkripce u virů mohla být přímo spřažena s translací na hostitelských ribozomech.
Předmětem tohoto projektu je objasnění mechanismu transkripčně-translačního spřažení a lepší pochopení mechanismů genové regulace u bakterií. Po biochemické stránce charakterizujeme spřažení transkripce a translace u bakterií a strukturně popíšeme spřažené komplexy pomocí kryo-elektronové mikroskopie.
Naším cílem je otestovat hypotézu, že replikace cytoplasmatických DNA virů vyžaduje spřažení transkripce a translace. Kryo-elektronová tomografie bude využita na vizualizaci in situ uspořádání ribozomů ve virových továrnách u infikovaných buněk. Naše strukturní studie může vést k novým farmakologickým přístupům inhibice virových infekcí.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 4
2022
-
CryoEM ensemble reveals the mechanism of 1 ribosomal frame shifting
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Ensemble and time-resolved cryo-EM in transcription and translation
Year: 2022, type: Conference abstract
2021
-
Structural basis for+1 ribosomal frameshifting during EF-G-catalyzed translocation
Nature Communications, year: 2021, volume: 12, edition: 1, DOI
-
Time-resolved cryo-EM visualizes ribosomal translocation with EF-G and GTP
Nature Communications, year: 2021, volume: 12, edition: 1, DOI