Informace o projektu
Simultaneous gene transcription and translation
- Kód projektu
- GJ20-16013Y
- Období řešení
- 1/2020 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Juniorské granty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
U prokaryot je nově přepsaná RNA okamžitě navázána na ribozomy a transkripce je tak přímo spřažena s translací. To je v přímém kontrastu s transkripcí a translací u eukaryot, kde jsou oba procesy odděleny jadernou membránou. Některé ds DNA viry se nicméně replikují v cytoplasmatických továrnách infikovaných eukaryotických buněk, což zvyšuje pravděpodobnost toho, že by transkripce u virů mohla být přímo spřažena s translací na hostitelských ribozomech.
Předmětem tohoto projektu je objasnění mechanismu transkripčně-translačního spřažení a lepší pochopení mechanismů genové regulace u bakterií. Po biochemické stránce charakterizujeme spřažení transkripce a translace u bakterií a strukturně popíšeme spřažené komplexy pomocí kryo-elektronové mikroskopie.
Naším cílem je otestovat hypotézu, že replikace cytoplasmatických DNA virů vyžaduje spřažení transkripce a translace. Kryo-elektronová tomografie bude využita na vizualizaci in situ uspořádání ribozomů ve virových továrnách u infikovaných buněk. Naše strukturní studie může vést k novým farmakologickým přístupům inhibice virových infekcí.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 4
2022
-
CryoEM ensemble reveals the mechanism of 1 ribosomal frame shifting
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Ensemble and time-resolved cryo-EM in transcription and translation
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
2021
-
Structural basis for+1 ribosomal frameshifting during EF-G-catalyzed translocation
Nature Communications, rok: 2021, ročník: 12, vydání: 1, DOI
-
Time-resolved cryo-EM visualizes ribosomal translocation with EF-G and GTP
Nature Communications, rok: 2021, ročník: 12, vydání: 1, DOI