Project information
Czech-Swiss Biobank Infrastructure Initiative for FAIR Data and Quality Certification (CS-BIQ)
(CS-BIQ)
- Project Identification
- MSMT-23304
- Project Period
- 1/2026 - 12/2028
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Education, Youth and Sports of the CR
- Czech-Swiss Research Infrastructure Initiative
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
- Keywords
- biobank, FAIR data, quality certification
- Cooperating Organization
-
Charles University
- Responsible person prof. Kateřina Jirsová, Ph.D.
- Responsible person prof. Jiří Drábek, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Zdenka Dudová, Ph.D.
- Responsible person prof. Ing. et Mgr. Blanka Stibůrková, Ph.D.
- Responsible person doc. Mgr. Kateřina Machová Poláková, Ph.D.
Oba národní uzly konsorcia BBMRI-ERIC reprezentující Česko a Švýcarsko – se zaměřují na (technologickou) podporu partnerských biobank v oblasti kvality biologického materiálu a připravenosti dat v jejich institucích. Silný důraz je kladen na FAIRifikaci uloženého biologického materiálu a dat, která jsou dostupná ke vzorkům uložených v biobankách. BBMRI.cz pilotuje vývoj a implementaci katalogu vzorků a dat, který je založen na systematické integraci dat a detailním datovém modelu. Tento projekt umožní českým biobankám zapojit se do FAIRifikační aktivity a nastavit si lokální procesy tak, aby mohly automaticky plnit katalog metadaty a zvýšit dohledatelnost, dostupnost a interoperabilitu svých vzorků a dat. Švýcarské zkušenosti a dobře zavedený systém správy dat na národní úrovni posílí české aktivity a poskytnou vedení českému týmu při jejich aktivitách stran integrace a katalogizace (meta)dat. Na konci tohoto projektu budou mít evropští výzkumníci možnost najít potřebné informace pro sestavení výzkumných kohort obsahujících vzorky a jejich doplňková data z obou zemí ve stejné kvalitě a formátu.
V rámci navrhovaného projektu bude realizována i aktivita zaměřená na zvyšování kvality biobankovacích procesů a systémového řízení kvality biobank. Tato aktivita bude probíhat ve spolupráci s evropskou výzkumnou infrastrukturou BBMRI-ERIC (Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure - European Research Infrastructure Consortium) a povede k získání mezinárodně uznávané značky Kvality BBMRI-ERIC (BBMRI-ERIC Quality Label). Cílem aktivity je provedení komplexního interního a následně externího hodnocení procesů v biobance podle mezinárodních standardů, které bude provedeno ve spolupráci se švýcarskými experty na kvalitu vzorků a dat. Na konci projektu budou zapojené české biobanky dostatečně pokročilé v oblasti správy dat a FAIRifikace, aby mohly poskytovat veškerá potřebná metadata do katalogu data.bbmri.cz a získat BBMRI-ERIC Quality Label. Tento štítek bude propagován v katalogu BBMRI-ERIC Directory, čímž se zvýší prestiž českých i švýcarských kolekcí, respektive biobank. Tento krok významně podpoří zajištění transparentnosti, reprodukovatelnosti a důvěryhodnosti výzkumu využívajícího vzorky z biobanky.