Project information
From environmental filtering to repeatome arms races: what drives genome size evolution in flowering plants?
(FEFRAR)
- Project Identification
- GA26-22791S
- Project Period
- 1/2026 - 12/2028
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
- Cooperating Organization
-
Institute of Biophysics
- Responsible person Ing. Pavel Jedlička, Ph.D.
- Responsible person Ing. Radim Čegan, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Marie Krátká
- Responsible person Mgr. Zdeněk Kubát, PhD
- Responsible person Mgr. Šárka Kobzová
Kauzalitu v evoluci nejlépe testuje experiment. Vegetační snímky databáze EVA nabízejí miliony selekčně-kompetičních pokusů s velikostí genomu napříč Evropou za podmínek “měřených” s mikrostanovištní přesností Ellenbergovými indikačními hodnotami druhů ve snímku. V kombinaci s dnešním nárůstem znalosti velikostí genomu právě evropských angiosperm nám to skýtá unikátní šanci kauzálně objasnit, jak selekce velkých genomů (1) roste podél gradientů prostředí a (2) jakými směry zužuje ekologickou niku rostlin a odhalit tím také skutečné příčiny zvláštního latitudinálního S-gradientu velikosti angiospermních genomů. Srovnáním pozitivní selekce s epigenetickou regulací proteinů LTR-transpozonů u stenoendemitních druhů rodů Aloe a Euphorbia chceme odhalit, (3) jak evoluční závody ve zbrojení mezi hostitelem a parazitem (genom a LTR) mění adaptivně velikost genomu techto druhů od Jižní Afriky po Evropu. Projekt propojuje specialisty na ekologii vegetace, genomiku repeatů a evoluci velikosti genomu v unikátně složený mezioborový tým.
Kombinováním analýz sekvencí dlouhých readů, repeatomové dynamiky a selekčních režimů s průtokovou cytometrií a fylogeneticky korigovanými statistickými analýzami dat vegetačních snímků ověříme kauzalitu toho, zda prostředí filtruje distribuci rostlin podle velikosti jejich genomů.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.