Project information
Protein liquid-liquid phase separation and intrinsic disorder in bacterial transcription
- Project Identification
- GA25-16037S
- Project Period
- 1/2025 - 12/2027
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Central European Institute of Technology
- prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
- Mgr. Viktor Bartošík
- Mgr. Martin Černý, Ph.D.
- Séverine Jansen, PhD.
- Mgr. Petr Padrta, Ph.D.
- Mgr. Dávid Tužinčin
- Cooperating Organization
-
Institute of Microbiology of the ASCR, v. v. i.
- Responsible person Mgr. Libor Krásný, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Tomáš Kovaľ, Ph.D.
Výsledkem separace bílkovin v kapalné fázi (LLPS) jsou kondenzáty, které hrají v buňce klíčovou roli. LLPS často závisí na vnitřně neuspořádaných proteinech. O LLPS u bakterií je
známo velmi málo. Nedávno jsme pozorovali neočekávanou LLPS u částečně neuspořádaného mykobakteriálního faktoru sigma (SigA, podjednotka RNAP) in vitro. To naznačuje, že bakterie
může využívat LLPS k organizaci svého transkripčního aparátu. Dále jsme identifikovali dosud neznámý transkripční faktor (UCP7) ze stejné bakterie složený ze strukturovaných a neuspořádaných částí. Navrhujeme prozkoumat význam LLPS v bakteriální transkripci s využitím Mycobacterium smegmatis jako modelového systému. Popíšeme dynamiku proteinů
SigA a UCP7 a charakterizujeme jejich schopnost tvořit LLPS. Definujeme role jejich nestrukturovaných částí v transkripci. Celkově pak projekt poskytne komplexní model fungování
nestrukturovaných částí bakteriálního transkripčního aparátu a odhalí, zda/jak LLPS ovlivňuje expresi prokaryotických genů.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
