Cílem projektu je odhalit regulační vztahy mezi transkripčním faktorem kódovaným MONOPTEROS (MP) a jím řízenými cílovými geny během procesu somatické embryogeneze (SE) závislé na auxinu u Arabidopsis. PB1 doména MP je nezbytná pro jeho transkripční represi při nízkých hladinách auxinu. Alternativním sestřihováním vzniká izoforma MP11ir, jejímž výsledkem je zkrácený protein MP bez domény PB1. Předběžné studie polského a českého týmu identifikovaly MP11ir během procesu SE v Arabidopsis. Tento výzkum zmapuje mechanismus působení MP11ir a MP během procesu SE vytvořením genetické sítě MP11ir
/MP. Technikou greenCUT&RUN bude sestaven seznam genů pod jejich přímou kontrolou, filtrovaných pro jejich rozdílnou expresi během embryogenního přechodu bioinformatickou analýzou. Vybrané kandidátní geny budou funkčně posouzeny. Projekt identifikuje a charakterizuje nové geny s klíčovou úlohou v embryogenních přechodech přímo regulovaných MP11ir/MP a rozšíří znalosti o úloze izoforem ve vývoji rostlin.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Publications