Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Disposition, distribution, and processing of DNA lesions in the genome of Arabidopsis thaliana plants defective in DNA repair and nucleosome assembly

Information

This project doesn't include Faculty of Science. It includes Central European Institute of Technology. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
GA23-06643S
Project Period
1/2023 - 12/2025
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology
Cooperating Organization
Institute of Biophysics
  • Responsible person Mgr. Vratislav Peška, Ph.D.

Rostliny A.thaliana postrádající histonový chaperon Chromatin assembly factor 1 (fas1 and fas2 mutanty) vykazují známky nestability genomu, např. hromadění DNA lézí, ztrátu repetic a tandemové duplikace genů. Naše nedávná studie ukázala, že k potlačení ztráty repetic u fas1 rostlin dochází při absenci ATM kinázy ve fas1atm mutantní linii. Protože ATM představuje klíčový regulační protein při opravách dvouřetězcových DNA zlomů (DSBs), vedoucí ke ztrátě repetic, zůstává otázkou, jak často je tento typ lézí formován ve fas1atm rostlinách a zda DSB představují primární typ poškození ve fas1. Není také zcela jasné, jakým způsoben jsou léze ve fas1 a fas1atm rozpoznány a opravovány. V tomto projektu využijeme přístupů DNA damage-seq k odhalení genomové distribuce DNA lézí a objasníme dopad jednotlivých reparačních drah při zpracování poškození DNA pomocí in vivo mikroskopie. Cílem v širším měřítku je prozkoumat klíčové otázky zabývající se odolností rostlinných systémů vůči vnějším a vnitřním genotoxickým zdrojům, a to za využití rostlin defektních v opravných mechanizmech DNA.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Sustainable Development Goal No. 3 – Good health and well-being Sustainable Development Goal No. 9 – Industry, innovation and infrastructure Sustainable Development Goal No. 15 – Life on land

Publications

Total number of publications: 4

2024

2023

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.