Project information
Charakteristika dynamické struktury a interakcí PG domény karbonát anhydrázy IX s ohledem na inhibici
- Project Identification
- MUNI/C/0003/2022
- Project Period
- 3/2022 - 2/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Grant Agency of Masaryk University
- Excellent diploma thesis
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Pevné nádory patří k nejčastěším typům rakovinného bujení lidských buněk. Pro jejich vznik a rozvoj jsou charakteristické specifické změny buněčného metabolismu, zejména zvýšení glykolýzy na úkor oxidativních procesů. Tento jev ovšem vede k výraznému okyselení prostředí, se kterým se nádorové buňky musí vyrovnat. Klíčovou roli v této životně důležité adaptaci hraje karbonát anhydráza IX (CA IX). Výskyt CA IX je ve zdravém lidském těle značně omezený, naopak v rámci pevných nádorů je nalézána zcela běžně a bývá spojována s pokročilími stádii onemocnění a špatnou prognózou. Celkově se tedy jedná o vhodný cíl pro vývoj chemoterapeutik. Tento je však komplikován strukturní podobností katalytické domény napříč izoformami karbonát anhydrázy, z nichž některé hrají významnou roli v metabolismu mnoha tkání, jakož i obtížností přípravy tohoto proteinu. Cílem této práce je tedy řešení nastíněného problému pomocí metod výpočetní chemie a návrh účinného, selektivního inhibitoru CA IX. Předpokládá se aplikace molekulárního dokování a především různých specializovaných metod molekulové dynamiky.
Publications
Total number of publications: 1
2023
-
Employment of 5D non-uniform sampling NMR assignment strategy to assign disordered protein regions with repetitive motifs
Year: 2023, type: Conference abstract