Project information
Unlocking evolutionary secrets of false flax and its relatives
- Project Identification
- GA21-03909S
- Project Period
- 1/2021 - 12/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Tribus Camelineae (Brassicaceae, brukvovité) je z vědeckého hlediska nejdůležitejší skupinou brukvovitých rostlin. Několik druhů huseníčků převratným způsobem změnilo experimentální rostlinnou biologii, zatímco lnička (Camelina) je ekonomicky nejvýznamnějším rodem tribu. Vzhledem k rostoucí důležitosti lničky jako olejnaté plodiny, je překvapivě málo známo o struktuře a evoluci genomu lniček. Podobně neprobádané zůstávají genomy druhů nejblíže příbuzných huseníčkům a lničkám. Plánujeme zkoumat vznik, strukturu a evoluci vybraných Camelineae genomů prostřednictvím srovnávacího malování chromosomů, genomového sekvenování a fylogenetické analýzy. Výstupy projektu budou zahrnovat (i) srovnávací cytogenomické mapy, (ii) objasněné rodičovství polyploidních genomů, (iii) robustní fylogenetický strom rodu Camelina, (iv) srovnání neznámých diploidních Camelina genomů na sekvenční a chromosomové úrovni, (v) nové objevy v evoluční historii polyploidního komplexu rodu Camelina, a (vi) struktury genomů potenciálně nových modelových druhů příbuzných huseníčku rolnímu.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 7
2023
-
An updated classification of the Brassicaceae (Cruciferae)
PHYTOKEYS, year: 2023, volume: 2023, edition: 220, DOI
-
Cycles of satellite and transposon evolution in <i>Arabidopsis</i> centromeres
Nature, year: 2023, volume: 618, edition: 7965, DOI
-
Global Brassicaceae phylogeny based on filtering of 1,000-gene dataset
Current Biology, year: 2023, volume: 33, edition: 19, DOI
-
The evolution of the hypotetraploid Catolobus pendulus genome – the poorly known sister species of Capsella
Frontiers in Plant Science, year: 2023, volume: 14, edition: May, DOI
2022
-
Chloroplast phylogenomics in Camelina (Brassicaceae) reveals multiple origins of polyploid species and the maternal lineage of C. sativa
Horticulture Research, year: 2022, volume: 9, edition: January, DOI
-
The identification of the missing maternal genome of the allohexaploid camelina (Camelina sativa)
Plant Journal, year: 2022, volume: 112, edition: 3, DOI
2021
-
The genetic and epigenetic landscape of the Arabidopsis centromeres
Science, year: 2021, volume: 374, edition: 6569, DOI