Project information
Evolution of genome size - a new role for the centromere drive
(Centrogenomtah)
- Project Identification
- GA20-15989S
- Project Period
- 1/2020 - 6/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Jelikož mechanika buněčného dělení vyžaduje zachování poměru mezi velikostí chromosomů a kinetochorů, měly by změny ve velikosti kinetochoru být reflektovány velikostními změnami chromosomů (a v konečném důsledku i genomů). Přestože je centromerický tah („drajv“) široce akceptován jako mechanismus evoluce kinetochorů u eukaryot s asymetrickou meiózou, dopad tohoto tahu na evoluci velikosti chromosomů a velikosti genomu nebyl nikdy studován. S využitím karyologie (u mitotických metafází) a průtokové cytometrie (v interfázních jádrech) v kombinaci s imunofluorecenčním barvením proto hodláme fylogeneticky analyzovat, jak tempo v evoluci velikosti chromosomů a genomů koreluje s tempem evoluce velikosti kinetochorů a intenzitou pozitivní selekce v evoluci CenH3 napříč eukaryoty: u „drajvujících“ živočichů a semenných rostlin oproti „nedrajvujícím“ houbám, mechorostům, plavuním a kapradinám i na jemné fylogenetické škále v modelových Brassicaceae a Poaceae s jejichž využitím budou validovány a optimalizovány klíčové analytické techniky.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 16
2024
-
Centromere drive may propel the evolution of chromosome and genome size in plants
Annals of Botany, year: 2024, DOI
-
Genome size is positively correlated with extinction risk in herbaceous angiosperms
New Phytologist, year: 2024, volume: 243, edition: 6, DOI
-
Genome size variation in Cape schoenoid sedges (Schoeneae) and its ecophysiological consequences
American Journal of Botany, year: 2024, volume: 111, edition: 8, DOI
-
The global distribution of angiosperm genome size is shaped by climate
New Phytologist, year: 2024, volume: 242, edition: 2, DOI
2023
-
An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
BMC Genomics, year: 2023, volume: 24, edition: 1, DOI
-
Complex patterns of ploidy in a holocentric plant clade (Schoenus, Cyperaceae) in the Cape biodiversity hotspot
Annals of Botany, year: 2023, volume: 131, edition: 1, DOI
-
Evolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal
Preslia, year: 2023, volume: 95, edition: 1, DOI
-
Hybridization may endanger the rare North Apennine endemic Cirsium bertolonii
Plant Systematics and Evolution, year: 2023, volume: 309, edition: 3, DOI
2022
-
Application-based guidelines for best practices in plant flow cytometry
Cytometry: Part A, year: 2022, volume: 101, edition: 9, DOI
-
Holocentric plants are more competitive under higher UV-B doses
New Phytologist, year: 2022, volume: 233, edition: 1, DOI