Project information
Atomically resolved in vivo NMR spectroscopy as a novel tool for biological testing of therapeutically important genomic non-canonical DNA targets and their interactions with drugs in phenotypically diversified cancer cells.
- Project Identification
- NV19-08-00450
- Project Period
- 5/2019 - 12/2022
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2015 - 2022
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
St. Anne's University Hospital Brno
- Responsible person Mgr Pavel Krejčí, Ph.D.
Postupy pro vývoj nových terapeutik proti neoplastickým onemocněním gastro-intesticinálního traktu a pankreatu jsou v současné době založeny na využívání modelových buněčných linií. Biologické parametry těchto buněčných linií se ovšem v mnoha důležitých aspektech odlišují od parametrů buněk v tzv. primárních neoplastických tkáních reálných pacientů. Ukazuje se, že nezahrnutí těchto rozdílů do procesu vývoje léčiv ve svém výsledku vede k tomu, že vyvinutá léčiva vykazují sníženou biologickou aktivitou v průběhu terapie a nebo jsou funkční jen pro velmi omezený okruh pacientů.
V rámci výzkumného projektu prováděného na našem pracovišti se snažíme, společně s výzkumnými týmy Lékařské fakulty a Středoevropského technologického institutu Masarykovy univerzity, vyvinout nové postupy pro stanovení vlivu vnitrobuněčného prostředí neoplastické tkáně na specifitu interakce mezi léčivem a molekulárním efektorem zprostředkovávajícím vlastní terapeutický účinek. Zároveň vyhodnocujeme potenciál využití těchto nových metod pro řízení léčebného postupu pro konkrétního pacienta.
Publications
Total number of publications: 9
2023
-
A thermosensitive gel matrix for bioreactor-assisted in-cell NMR of nucleic acids and proteins
Journal of biomolecular NMR, year: 2023, volume: 77, edition: 5-6, DOI
2022
-
Fluorine Labeling as a Versatile Tool for Probing Nucleic Acid Folding and Interactions by NMR Spectroscopy
ALDRICHIMICA ACTA, year: 2022, volume: 55, edition: 2
2021
-
G-Quadruplex Formation by DNA Sequences Deficient in Guanines: Two Tetrad Parallel Quadruplexes Do Not Fold Intramolecularly
Chemistry - A European Journal, year: 2021, volume: 27, edition: 47, DOI
-
Towards Profiling of the G-Quadruplex Targeting Drugs in the Living Human Cells Using NMR Spectroscopy
International Journal of Molecular Sciences, year: 2021, volume: 22, edition: 11, DOI
2020
-
Composite 5-methylations of cytosines modulate i-motif stability in a sequence-specific manner: Implications for DNA nanotechnology and epigenetic regulation of plant telomeric DNA
BBA - General Subjects, year: 2020, volume: 1864, edition: 9, DOI
-
Dual Targeting of BRAF and mTOR Signaling in Melanoma Cells with Pyridinyl Imidazole Compounds
Cancers, year: 2020, volume: 12, edition: 6, DOI
-
HERMES - A Software Tool for the Prediction and Analysis of Magnetic-Field-Induced Residual Dipolar Couplings in Nucleic Acids
ChemPlusChem, year: 2020, volume: 85, edition: 9, DOI
-
In-cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids
IN-CELL NMR SPECTROSCOPY: FROM MOLECULAR SCIENCES TO CELL BIOLOGY, year: 2020, volume: 21, edition: 2020, DOI
-
Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae
Journal of Biological Chemistry, year: 2020, volume: 295, edition: 27, DOI