Project information
The polyploid past versus diploid present: evolution and diversification of the southern African Heliophila
- Project Identification
- GA19-07487S (kod CEP: GA19-07487S)
- Project Period
- 1/2019 - 12/2021
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Tribus Heliophileae s jediným rodem Heliophila obsahuje c. 100 druhů endemických v jižní Africe. Heliophileae jsou morfologicky nejdiverzifikovanějším tribem čeledi brukvovitých ve všech aspektech jakými jsou životní forma, olistění a morfologie květů a plodů. Navzdory této rozmanitosti jsou původ tribu a jeho vnitrotribová struktura nejasné. Naše předběžná cytogenetická studie odhalila triplikaci ancestrálních genomických bloků v genomech několika diploidních Heliophila druhů, dokazující hexaploidní původ tribu. Cytogenetická data prozrazují, že v diverzifikaci Heliophileae hrála pravděpodobně klíčovou roli post-polyploidní diploidizace asociovaná s redukcí chromosomového počtu z původně hexaploidního k dnešním quasi-diploidním genomům. Navrhovaný project si klade za cíl využít kombinaci nejmodernějších metodických přístupů (srovnávací cytogenetika, celogenomové sekvenování, analýza repetitivní DNA, modelace ekologických nik) k odhalení podstaty post-polyploidní diploidizace v tribu Heliophileae a jejího efektu na diverzifikaci a adaptivní radiaci tribu.
Publications
Total number of publications: 5
2024
-
Drought and life-history strategies in Heliophila (Brassicaceae)
New Phytologist, year: 2024, volume: 241, edition: 2, DOI
2023
-
The meso-octoploid Heliophila variabilis genome sheds a new light on the impact of polyploidization and diploidization on the diversity of the Cape flora
Plant Journal, year: 2023, volume: 116, edition: 2, DOI
2022
-
Heliophila verna (Brassicaceae), a new species from the Northern Cape of South Africa
Phytotaxa, year: 2022, volume: 555, edition: 2, DOI
-
Idahoa and Subularia: Hidden polyploid origins of two enigmatic genera of crucifers
American Journal of Botany, year: 2022, volume: 109, edition: 8, DOI
2021
-
Evolution of Tandem Repeats Is Mirroring Post-polyploid Cladogenesis in Heliophila (Brassicaceae)
Frontiers in Plant Science, year: 2021, volume: 11, edition: JAN, DOI