Project information
Characterization of the molecular mechanisms of the human adenosine demethylases
- Project Identification
- GA19-21829S (kod CEP: GA19-21829S)
- Project Period
- 1/2019 - 12/2021
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
N6-methyladenosine (m6A) je nejčastější interní modifikace eukaryotických mRNA. Tato modifikace má potenciál regulovat řadu funkcí mRNA. Faktory, které se účastní metylace, jejího rozpoznání a také odstranění jednak ovlivňují téměř všechny aspekty životního cyklu mRNA, a také řadu dalších buněčných, vývojových pochodů a onemocnění. Přes intenzivní výzkum, v tomto oboru existuje řada kontroverzních publikací a nedořešených otázek, zejména v oblasti demetyláz, tzv. "eraserů". Obě známé demetylázy FTO a ALKBH5 mají funkci v procesování mRNA, ale princip jejich účinku nebyl dosud vysvětlen. Navíc stále existují nejasnosti, jaké různé modifikace a nukleotidy dokáže FTO demodifikovat in vivo. Tento projekt si klade za cíl odpovědět na tyto důležité otázky. Zahrnuje studium mechanismu FTO v procesování mRNA, důkladné testování jeho aktivity a studium funkce pomocí odhalení interakčních partnerů in vivo.
Publications
Total number of publications: 2
2022
-
HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 reveals interactions with fully processed substrate tRNAs and with specific noncoding RNAs
RNA, year: 2022, volume: 28, edition: 12, DOI
2021
-
The comprehensive interactomes of human adenosine RNA methyltransferases and demethylases reveal distinct functional and regulatory features
Nucleic acids research, year: 2021, volume: 49, edition: 19, DOI