Project information
Úloha Nse1/Nse3/Nse4, E3-ubikvitin ligásy, ve stabilitě genomu
- Project Identification
- GA18-02067S
- Project Period
- 1/2018 - 12/2020
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Projekt navazuje na předchozí výsledky ukazující reparaci většiny dvojvláknových zlomů DNA (DSB) indukovaných genotoxiny pomocí proteinů udržujících strukturu chromosomů SMC. Reparace DSB jako biomarker homologní rekombinace (HR) a nehomologního spojování konců (NHEJ) bude studována cytologickými (kometový test, imunologická lokalizace reparačních ohnisek foci) a molekulárně biologickými (indukce transkripce, ligace a rekombinace reportérového substrátu in situ) a dalšími metodami u knock-out a RNAi mutant SMC, SMCHD a podobného MRN komplexu. Cílem projektu je ozřejmit pravděpodobnou funkci SMC protejnů a zejména jejich cirkulární struktury pomocí kleisinů při rozpoznání a stabilizaci zlomu a podíl na signalizaci a volbě následného mechanism reparace DSB u mechu Physcomitrella patens.
Publications
Total number of publications: 7
2022
-
Role of Nse1 Subunit of SMC5/6 Complex as a Ubiquitin Ligase
Cells, year: 2022, volume: 11, edition: 1, DOI
2020
-
A role of the Nse4 kleisin and Nse1/Nse3 KITE subunits in the ATPase cycle of SMC5/6
Scientific reports, year: 2020, volume: 10, edition: 1, DOI
-
Molecular insights into the architecture of the human SMC5/6 complex
Journal of Molecular Biology, year: 2020, volume: 432, edition: 13, DOI
2019
-
Multicomponent Yeast Two-Hybrid System: Applications to Study Protein-Protein Interactions in SMC Complexes.
Methods in Molecular Biology, year: 2019, number of pages: 12 s.
-
SMC5/6: Multifunctional Player in Replication
GENES, year: 2019, volume: 10, edition: 1, DOI
2018
-
Genetic analysis of a relation between SMC5/6 and SAGA chromatin modifying complex
Year: 2018, type: Conference abstract
-
Genetic analysis of a relation between SMC5/6 and SAGA chromatin modifying complex
XIX. setkání biochemiků a molekulárních biologů, year: 2018