Project information
Identifikace nových prognostických markerů a terapeutických cílových molekul u sarkomu měkkých tkání
- Project Identification
- GA17-17636S
- Project Period
- 1/2017 - 12/2019
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
Charles University
- Responsible person doc. Ing. Jiří Hatina, CSc.
Sarkomy jsou relativně vzácné nádory mesenchymálního původu vyznačující se neobyčejně velkou klinickou heterogenitou. Dosud identifikované markerové proteiny či expresní profily nevedly k racionální stratifikaci pacientů. V našem projektu chceme využít některé nové biologické aspekty sarkomageneze (prominentní funkce onkogenů jun, sarkomové kmenové buňky, využití progresivních sérií buněčných linií) k identifikaci nových progresivních markerů popř. terapeutických cílů sarkomů měkkých tkání. V prvním kroku podrobíme dvě dobře charakterizované progresivní série nádorových buněčných linií komplexní analýze transkriptomu, a to jak na základě stádia progrese, tak na základě buněčné hierarchie (tj. transkriptom sarkomových kmenových buněk). Postupnými průniky dílčích transkriptomů chceme dojít až k možnému výslednému expresnímu profilu agresivnosti. Prognostickou hodnotu budeme testovat na panelu lidských liposarkomových buněčných linií a na vzorcích klinickým nádorů se známým
klinickým průběhem. Podaří-li se nám současně najít nové terapeutické cíle, zahájíme jejich preklinické testování.
Publications
Total number of publications: 6
2021
-
Complex Interplay of Genes Underlies Invasiveness in Fibrosarcoma Progression Model
Journal of Clinical Medicine, year: 2021, volume: 10, edition: 11, DOI
2019
-
Analýza dlouhých nekódujících RNA v tkáni multiformního glioblastomu a jejich asociace s celkovým přežíváním
Year: 2019, type: Conference abstract
-
Dysregulated expression of lncRNAs in glioblastoma multiforme and their association with overall survival
Year: 2019, type: Conference abstract
-
Global analysis and validation of miRNA levels in cerebrospinal fluid of brain tumor patients
Year: 2019, type: Conference abstract
-
Sarcoma Stem Cell Heterogeneity
STEM CELLS HETEROGENEITY - NOVEL CONCEPTS, year: 2019, volume: 1123, edition: 2019, DOI
2018
-
Identification of candidate genes underlying soft tissue sarcoma progression using a progression series of murine fibrosarcoma cell lines
Year: 2018, type: Conference abstract