Project information
Chybějící souvislosti: evoluce genomu v tribu Camelineae (brukvovité)
- Project Identification
- GA17-13029S
- Project Period
- 1/2017 - 12/2019
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Tribus Camelineae (CAMEL; 32 druhů, 8 rodů), obsahující modelový rod Arabidopsis, je z vědeckého hlediska nejdůležitější skupinou brukvovitých (Brassicaceae). Vedle několika modelových druhů, tento tribus také zahrnuje významné plevelné druhy a sekvenovaný genom lničky seté (Camelina sativa; aktraktivní zdroj biopaliv). Navzdory své potenciální důležitosti, genomy několika druhů tribu CAMEL zůstávají neprozkoumány nebo jsou zcela neznámé. O vzniku a evoluci těchto přehlížených genomů existuje překvapivě málo informací. Cílem našeho projektu je charakterizovat chybějící souvislosti mezi dobře známými i neznámými CAMEL genomy prostřednictvím rekonstrukce evoluce genomu v tribu CAMEL i blízce příbuzných tribech. S použitím srovnávacích cytogenomických a fylogenetických přístupů plánujeme (re)konstruovat srovnávací cytogenomické mapy a ancestrální genomy, identifikovat mechanismy genomových přestaveb, a rekonstruovat fylogenetickou strukturu a postavení tribu CAMEL. Naše výsledky by měly inciovat trnaslační výzkum, etablování nových modelových druhů a celogenomové sekvenační projekty.
Publications
Total number of publications: 6
2021
-
Parallelism in gene expression between foothill and alpine ecotypes in Arabidopsis arenosa
Plant Journal, year: 2021, volume: 105, edition: 5, DOI
2019
-
Camelina neglecta (Brassicaceae, Camelineae), a new diploid species from Europe
PHYTOKEYS, year: 2019, volume: JAN, edition: 115, DOI
-
Genome invasion by a hypomethylated satellite repeat in Australian crucifer Ballantinia antipoda
Plant Journal, year: 2019, volume: 99, edition: 6, DOI
-
Healthy Roots and Leaves: Comparative Genome Structure of Horseradish and Watercress
Plant Physiology, year: 2019, volume: 179, edition: 1, DOI
-
Origin and Evolution of Diploid and Allopolyploid Camelina Genomes Were Accompanied by Chromosome Shattering
Plant Cell, year: 2019, volume: 31, edition: 11, DOI
-
The story of promiscuous crucifers: origin and genome evolution of an invasive species, Cardamine occulta (Brassicaceae), and its relatives
Annals of Botany, year: 2019, volume: 124, edition: 2, DOI