Project information
Struktura a dynamika biopolymerů
- Project Identification
- MUNI/A/0809/2012
- Project Period
- 1/2013 - 12/2013
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Grant Agency of Masaryk University
- Category A
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Mgr. Martin Babinský, Ph.D.
- Mgr. Marek Bartošovič, Ph.D.
- RNDr. Miroslav Brumovský, Ph.D.
- Mgr. Gabriel Demo, Ph.D.
- Mgr. Matúš Durec, Ph.D.
- doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
- Mgr. Ing. Crina-Maria Ionescu, Ph.D.
- Deepti Jaiswal, Ph.D.
- Mgr. Pavel Janoš, Ph.D.
- Olga Jasnovidova, Ph.D., M.Sc.
- Jitka Kasalová
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Mgr. Jan Komárek, Ph.D.
- Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
- Mgr. Vojtěch Kubáň, Ph.D.
- doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D.
- Mgr. Radek Matuška
- Sushil Kumar Mishra, Ph.D.
- RNDr. Mgr. et Mgr. Arnošt Mládek, Ph.D.
- doc. Mgr. Markéta Munzarová, Dr. rer. nat.
- Mgr. Jiří Nováček, Ph.D.
- Mgr. Jan Novotný, Ph.D.
- Mgr. Jan Oppelt, Ph.D.
- Mgr. Olga Otrusinová
- Mgr. Josef Pasulka, Ph.D.
- Mgr. Gita Paulíková, Ph.D.
- RNDr. Lukáš Pravda, Ph.D.
- Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
- prof. RNDr. Petr Skládal, CSc.
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- Mgr. Petra Sýkorová, Ph.D.
- Mgr. Tomáš Šikorský
- prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D.
- Mgr. Jakub Štěpán, Ph.D.
- Ing. Tomáš Trnka, Ph.D.
- prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
- prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Mgr. Dagmar Zigáčková, Ph.D.
- prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Projekt Struktura a dynamika biopolymerů bude zaměřen na integraci třírozměrných strukturních informací popisujících velké makromolekulární struktury - bílkoviny, nukleové kyseliny a jejich komplexy - do funkčního kontextu s cílem porozumět životně důležitým procesům na buněčné úrovni. Pro studium bude využita celá řada experimentálních metod s velkým rozsahem prostorového rozlišení, včetně rentgenové difrakce monokrystalů, nukleární magnetické rezonance a mikroskopie atomových sil společně s metodami poskytujícími informace o mezimolekulárních interakcích. Pro pochopení základních principů rozpoznávání molekul v živých organismech budou důležité systematické studie in-vitro za využití široké řady biofyzikálních nástrojů. Experimentální přístup bude doplněn teoretickými studiemi využívajícími výpočetní chemii, chemoinformatiku a bioinformatiku. Detailně bude studováno dynamické chování - časové proměny - třírozměrných struktur na široké časové škále 10E-10 – 10E-2 s, které poskytují informace nezbytné k získání uceleného obrazu o dynamice klíčových buněčných funkcí. Součástí projektu bude i vývoj moderních metod strukturní biologie a extrakce molekulárních dat důležitých pro biochemické a biomedicínské aplikace. Do řešení jednotlivých výzkumných projektů budou výrazně zapojeni studenti magisterského a doktorského studijního oboru biomolekulární chemie studijního programu biochemie, který je garantován Národním centrem pro výzkum biomolekul. Kromě toho se na projektech budou podílet i studenti ostatních studijních oborů a programů, na jejichž vzdělávání se Národní centrum pro výzkum biomolekul podílí.