Project information
Neinvazní bezkontaktní metody identifikace a charakterizace živých mikroorganismů prostřednictvím optické spektroskopie a mikromanipulace
- Project Identification
- GAP205/11/1687
- Project Period
- 1/2011 - 12/2014
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D.
- Ing. Veronika Holá, Ph.D.
- Zuzana Kršková
- prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Cooperating Organization
-
The Academy of Sciences of the Czech Republic
- Responsible person Mgr. Ota Samek, Dr.
Hlavním cílem navrhovaného výzkumného projektu je vývoj nových metod pro bezkontaktní neinvazní analýzu živých mikroorganismů (bakterií a eukaryotických buněk) v relevantních okolních podmínkách. Mikroorganismy suspendované v kapalném médiu či přisedlé k pevnému substrátu budou identifikovány a charakterizovány prostřednictvím jejich spekter Ramanova rozptylu, která poslouží jako otisk prstu typu buňky a jejího fyziologického stavu. Kombinace Ramanovy spektroskopie s optickými mikromanipulacemi a mikrofluidní platformou pak umožní provádění těchto analýz na úrovni jednotlivých buněk a studium odezvy mikroorganismů na definované vnější stimuly či stresové faktory. Experimentální data budou analyzována prostřednictvím vhodných matematických algoritmů a využita pro vytvoření spektrální knihovny mikroorganismů. Získané výsledky významně přispějí k rychlé identifikaci mikroorganismů ve studovaných vzorcích bez vnějších činidel a zhodnocení jejich infekčního potenciálu, čímž podpoří rozvoj efektivnějších strategií pro léčbu infekcí.
Publications
Total number of publications: 8
2015
-
Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers
Journal of Biomedical Optics, year: 2015, volume: 20, edition: 5, DOI
2014
-
Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy
International Journal of Molecular Sciences, year: 2014, volume: 15, edition: 12, DOI
-
Monitoring the influence of antibiotic exposure using Raman spectroscopy
Proceedings of SPIE : BIOMEDICAL VIBRATIONAL SPECTROSCOPY VI: ADVANCES IN RESEARCH AND INDUSTRY, year: 2014
-
Raman tweezers on bacteria: Following the mechanisms of bacteriostatic versus bactericidal action
Proceedings of SPIE : BIOPHOTONICS: PHOTONIC SOLUTIONS FOR BETTER HEALTH CARE IV, year: 2014
-
Výskyt Candida dubliniensis v klinickém materiálu a možnosti její identifikace
Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie, year: 2014, volume: 63, edition: 2
2013
-
Following the mechanisms of bacteriostatic versus bactericidal action using raman spectroscopy
Molecules, year: 2013, volume: 18, edition: 11, DOI
2012
-
Nové možnosti detekce a identifikace klinicky významných mikromycet
Postgraduální medicína, year: 2012, volume: 14, edition: příloha č. 5
-
Utilization of laser-ablation based methods for obtaining complete chemical information of Algae
World Academy of Science, Engineering and Technology, year: 2012, volume: 72, edition: 12