Project information
Struktura a dynamika biopolymerů
(SDB)
- Project Identification
- MUNI/A/0928/2009
- Project Period
- 1/2010 - 12/2012
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Grant Agency of Masaryk University
- Category A
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Ing. et Ing. Jan Adam, Ph.D.
- Mgr. Lenka Adamová, Ph.D.
- Mgr. Jan Alán
- Mgr. Veronika Altmannová, Ph.D.
- Mgr. Martin Babinský, Ph.D.
- Mgr. Sreenivas Reddy Bathula, Ph.D.
- Mgr. Daniela Baumgartnerová
- RNDr. Ivana Beššeová, Ph.D.
- Mgr. Kateřina Bouzková, Ph.D.
- Mgr. Hana Černá, Ph.D.
- Mgr. Gabriel Demo, Ph.D.
- Mgr. Eva Dubská
- Mgr. Eva Dudová
- Mgr. Lucie Durcová
- Mgr. Matúš Durec, Ph.D.
- Mgr. Michal Ďurech, Ph.D.
- doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
- Mgr. Andrea Fleková
- doc. Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D.
- Mgr. Jiří Fukal
- RNDr. Lenka Grycová, Ph.D.
- Mgr. Antonín Hlaváček, Ph.D.
- Fruzsina Hóbor, Ph.D., M.Sc.
- Mgr. Peter Holub, Ph.D.
- Mgr. Josef Houser, Ph.D.
- Mgr. Dominika Hroššová, Ph.D.
- Melita Chavdarova, Ph.D., M.Sc.
- Bc. Jakub Institoris
- Mgr. Ing. Crina-Maria Ionescu, Ph.D.
- Mgr. Adrián Jankových
- Mgr. Veronika Janštová, Ph.D.
- Ing. Milan Jílek
- Shivaji Sambhaji Kadam, Ph.D.
- Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D.
- Bc. Lucie Kaiserová
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Mgr. Peter Kolesár, Ph.D.
- Mgr. Jan Komárek, Ph.D.
- Mgr. Petr Kovács
- Mgr. David Kovář, Ph.D.
- Bc. Jan Králík
- Mgr. Martin Kříž
- Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
- Mgr. Vojtěch Kubáň, Ph.D.
- Mgr. Alexej Kulaš
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Mgr. Peter Kyseľ
- Mgr. Karel Lacina, Ph.D.
- Mgr. Jana Laláková, Ph.D.
- Mgr. Petra Literáková
- prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D.
- Mgr. Radek Matuška
- RNDr. Mgr. et Mgr. Arnošt Mládek, Ph.D.
- doc. Mgr. Markéta Munzarová, Dr. rer. nat.
- Mgr. Ivona Nečasová, Ph.D.
- Mgr. Jan Novotný, Ph.D.
- Mgr. Radka Obořilová
- Mgr. Veronika Ostapčuk
- Mgr. Olga Otrusinová
- Mgr. Gita Paulíková, Ph.D.
- Mgr. Lucia Petrova
- Mgr. Matej Pipíška
- Mgr. Marie Sárazová
- RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- Mgr. Kateřina Schmidtová
- Mgr. Alexandra Sisáková, Ph.D.
- prof. RNDr. Petr Skládal, CSc.
- Mgr. Leona Šerá
- Mgr. Radka Šigutová
- Mgr. Jan Škerle
- prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Mgr. Barbora Štefanovie, Ph.D.
- prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D.
- Mgr. Hana Uhlíková, Ph.D.
- prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Mgr. Tomáš Zlámal
- prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Projekt Struktura a dynamika biopolymerů bude zaměřen na integraci třírozměrných strukturních informací popisujících velké makromolekulární struktury - bílkoviny, nukleové kyseliny a jejich komplexy - do funkčního kontextu s cílem porozumět životně důležitým procesům na buněčné úrovni. Pro studium bude využita celá řada experimentálních metod s velkým rozsahem prostorového rozlišení, včetně rentgenové difrakce monokrystalů, nukleární magnetické rezonance a mikroskopie atomových sil společně s metodami poskytujícími informace o mezimolekulárních interakcích. Pro pochopení základních principů rozpoznávání molekul v živých organismech budou důležité systematické studie in-vitro za využití široké řady biofyzikálních nástrojů. Experimentální přístup bude doplněn teoretickými studiemi využívajícími výpočetní chemii a bioinformatiku. Detailně bude studováno dynamické chování - časové proměny - třírozměrných struktur na široké časové škále 10-10 až 10-2 s, které poskytují informace nezbytné k získání uceleného obrazu o dynamice klíčových buněčných funkcí. Součástí projektu bude i vývoj moderních metod strukturní biologie a extrakce molekulárních dat kriticky důležitých pro biochemické a biomedicíncké aplikace. Do řešení jednotlivých výzkumných projektů budou výrazně zapojeni studenti magisterského a doktorského studijního oboru biomolekulární chemie studijního programu biochemie, který je garantován Národním centrem pro výzkum biomolekul. Kromě toho se na projektech budou podílet i studenti ostatních studijních oborů a programů, na jejichž vzdělávání se Národní centrum pro výzkum biomolekul podílí.
Publications
Total number of publications: 1
2011
-
Structure and binding specificity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana.
The Plant Journal, year: 2011, volume: 67, edition: 5, DOI