Project information
Vypracování praktické úlohy věnované využití elektromigračních technik při studiu vlastností mikroorganismů
- Project Identification
- FRVS/1535/2010
- Project Period
- 1/2010 - 12/2010
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Education, Youth and Sports of the CR
- University Development Fund
- G - Students' Creative Activity
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- Ing. Anna Kubesová, Ph.D.
- doc. RNDr. Oldřich Janiczek, CSc.
- Mgr. Jiří Kučera, Ph.D.
Tento projekt si klade za cíl zavedení moderních trendů studia mikroorganismů do pokročilé praktické výuky na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Pro separaci biočástic včetně mikroorganizmů se jeví v posledních několika letech slibné použití kapilárních elektroforetických technik. V našem projektu se proto zaměříme na stanovení isoelektrických bodů (pI) biofilm-pozitivní a biofilm-negativní kvainek a další vlastnosti, které by byly přínosné pro jejich rychlou separaci a identifikaci. Pro separaci intaktních kvasinek bude použita technika kapilární isoelektrické fokusace s optickou detekcí. Biofilm-pozitivní a biofilm-negativní kvasinky se odlišují i svým proteomickým složením. Proto budou separovány lyzáty těchto kvasinek pomocí kapilární izoelektrické fokusace a i další technikou izoelektrické fokusace na polyakrylamidovém gelu. Jednotlivé zóny budou vyřezány a dále analyzovány pomocí kapalinové chromatografie s monolitickou kolonou.
Bude optimalizována separace lyzátů biofilmových a nebiofilmových kvasinek a zjišťovány rozdíly mezi separacemi, tzn. budou porovnávány jejich fingerprinty. Výsledkem bude jednoduchá, v porovnání se standardními mikrobiologickými postupy, časově nenáročná technika využitelná pro stanovení biofilm-pozitivních a biofilm-negativních mikroorganismů v biologických vzorcích.