Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LN00A016
- Období řešení
- 7/2000 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumná centra
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Biomolekulární centrum je koncipováno jako expertní pracoviště v oblasti studia struktury a vlastností biologicky významných molekul a polymerů, především proteinů a fragmentů nukleových kyselin. V horizontální rovině je cílem vybudování centras vynikajícím zázemím v metodách studia biomolekul na atomární úrovni s využitím NMR spektroskopie, počítačového modelování a rentgenové krystalografie spolu s patřičnou podporou v oblasti biochemie a molekulární biologie. Centrum bude schopné vertikálněstudovat biomolekulární systémy počínaje jejich atomární strukturou, přes in vitro biochemické projevy, až po jejich funkční projevy v živém organismu. Centrum ve finální podobě počítá s 25 kmenovými pracovníky. Centrum bude mít od počátku dobřepropracovanou vazbu na doktorské studium (14 PGS studentů). Na činnosti Centra se budou aktivně podílet postdoktorální stážisté a doktorandi (v závěrečné fázi 2/3 všech pracovníků). Kolektiv je již dnes aktivně zapojen do široké mezinárodní spolupráce.
Publikace
Počet publikací: 127
2005
-
RNA K-turns-Flexible Ribosomal Motifs:Dynamics, Hydration, Conformations and Biological Relevance
Workshop on Modeling Interactions in Biomolecules II, rok: 2005
-
Structural basis for the interaction between human milk oligosaccharides and a bacterial protein, Pseudomonas aeruginosa lectin PA-IIL,
Biochemical Journal, rok: 2005, ročník: 389, vydání: 2
-
The fucose-binding lectin from Ralstonia solanacearum: a new type of beta-propeller architecture formed by oligomerisation and interacting with fucoside, fucosyllactose and plant xyloglucan
Journal of Biological Chemistry, rok: 2005, ročník: 280, vydání: 30
2004
-
1H-13C Correlation Experiments for Detection of Quaternary Carbons in Nucleic Acid Bases
Abstracts of the VIth Central European NMR Symposium, rok: 2004
-
A Molecular Dynamics Study of the Cyclin-Dependent Kinase-2 (CDK2) with Substrate Peptide (HHASPRK), Inhibition of CDK2 by Phosphorylation
Materials in Structure Chemistry, Biology, Physics and Technology, rok: 2004
-
A new Ralstonia solanacearum high affinity mannose-binding lectin
Molecular Microbiology, rok: 2004, ročník: 52, vydání: 3
-
Activation and Inhibition of Cyclin-Dependent Kinase-2 by Phosphorylation; A Molecular Dynamics Study Reveals the Functional Importance of the Glycine-Rich Loop
Protein Science, rok: 2004, ročník: 13, vydání: 6
-
Analysis of Internal Motion from Molecular Dynamics of Major Urinary Protein I
Materials Structure, rok: 2004, ročník: 11, vydání: 1
-
Berberine and coptisine free bases
Journal of Molecular Structure, rok: 2004, ročník: 687, vydání: 1-3
-
Catalytic strategies of the hepatitis delta virus ribozyme as probed by molecular dynamics simulations.
Rok: 2004, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)