Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LN00A016
- Období řešení
- 7/2000 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumná centra
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Biomolekulární centrum je koncipováno jako expertní pracoviště v oblasti studia struktury a vlastností biologicky významných molekul a polymerů, především proteinů a fragmentů nukleových kyselin. V horizontální rovině je cílem vybudování centras vynikajícím zázemím v metodách studia biomolekul na atomární úrovni s využitím NMR spektroskopie, počítačového modelování a rentgenové krystalografie spolu s patřičnou podporou v oblasti biochemie a molekulární biologie. Centrum bude schopné vertikálněstudovat biomolekulární systémy počínaje jejich atomární strukturou, přes in vitro biochemické projevy, až po jejich funkční projevy v živém organismu. Centrum ve finální podobě počítá s 25 kmenovými pracovníky. Centrum bude mít od počátku dobřepropracovanou vazbu na doktorské studium (14 PGS studentů). Na činnosti Centra se budou aktivně podílet postdoktorální stážisté a doktorandi (v závěrečné fázi 2/3 všech pracovníků). Kolektiv je již dnes aktivně zapojen do široké mezinárodní spolupráce.
Publikace
Počet publikací: 127
2003
-
Aplikace molekulového modelování při studiu nukleových kyselin a proteinů
Rok: 2003, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)
-
Catalytic mechanism of the haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26
Journal of Biological Chemistry, rok: 2003, ročník: 278, vydání: 46
-
Cloning and characterization of a novel thermostable Mn(II)-dependent 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase from a PCB and naphthalene degrading Bacillus sp. JF8
Journal of Biological Chemistry, rok: 2003, ročník: 278, vydání: 24
-
Combining fold recognition and exploratory data analysis for searching for glycosyltransferases in the genome of Mycobacterium tuberculosis
Biochimie, rok: 2003, ročník: 85, vydání: 7
-
COMPUTER SIMULATIONS OF CYCLIN-DEPENDENT KINASE-2 NOTES ABOUT INHIBITION
Book of Abstracts, rok: 2003
-
Conformational Flexibility of DNA sequences studied by Advanced Molecular Mechanics and Dynamics Tools
Book of Abstracts, rok: 2003
-
Conformational Flexibility of Two RNA Trimers Explored by Computational Tools and Database Search
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, rok: 2003, ročník: 20, vydání: 5
-
Coordination number of zinc ions in the phosphotriesterase active site by molecular dynamics and quantum mechanics
Journal of Computational Chemistry, rok: 2003, ročník: 24, vydání: 3
-
Cyclin-Dependent Protein Kinase-2 Regulation by Phosphorylation, A Molecular Dynamics Study
Cellular and Molecular Biology Letters, rok: 2003
-
Formation Pathways of a Guanine-Quadruplex DNA Revealed by Molecular Dynamics and Thermodynamics Analysis of the Substates
Biophysical Journal, rok: 2003, ročník: 85, vydání: 3