Informace o projektu
Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
- Kód projektu
- GA203/01/1589
- Období řešení
- 1/2001 - 1/2003
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Regulaci mnoha genů u denitrifikačních bakterií zprostředkují transkripční aktivátory příbuzné FNR proteinu E. coli. Rozpad jejich železo-sirných center při prime reakci s kyslíkem snižuje schopnost dimerace a vazby na DNA. Existují však pozorování svědč ící o tom, že kyslík může také působit nepřímo snížením stupně redukce buněčných redoxaktivních složek a ovlivněním koncentrace Fe(II) v cytoplasmě. Jsou navrhovány tři vzájemně se doplňující způsoby testování této hypotézy. (1) Lze stanovit stupeň expre se jednotlivých proteinu (proteinové databáze získané dvourozměrnou elektroforézou, hemoproteiny a respirační enzymy), obsah jednotlivých hemů a promotorovou aktivitu závislou na FNR a porovnat odezvy aerobně rostlé kultury na redoxní posuny vyvolané lim itovanou aerací, inhibicí respiračních enzymů nebo přítomností thiolové sloučeniny. (2) Je možno získat a podrobně charakterizovat regulační mutanty s pozměněnou denitrifikační dráhou. (3) Lze purifikovat enzymy katalyzující redukci komplexů Fe(III) cyto
Publikace
Počet publikací: 15
2004
-
Examination of membrane protein expression in Paracoccus denitrificans by two-dimensional gel electrophoresis
Journal of Basic Microbiology, rok: 2004, ročník: 44, vydání: 1
-
Isolation and biochemical characterization of two soluble iron(III) reductases from Paracoccus denitrificans
European Journal of Biochemistry, rok: 2004, ročník: 271, vydání: 3
-
Protein composition of Paracoccus denitrificans cells grown on various electron acceptors and in the presence of azide
Proteomics, rok: 2004, ročník: 4, vydání: 9
-
Proteome study on bacterium Paracoccus denitrificans and construction of 2-DE protein database
VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., rok: 2004
-
The effects of terminal electron acceptor and sodium azide on the Paracoccus denitrificans protein composition
Acta Universitatis Palackianae Olomucensis - Chemica 43S, rok: 2004
2003
-
Analýza proteomu bakterie Paracoccus denitrificans
VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, rok: 2003
-
Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace
Chemické listy, rok: 2003, ročník: 97, vydání: 1
-
Fine-tuned regulation by oxygen and nitric oxide of the activity of a semi-synthetic FNR-dependent promoter and expression of denitrification enzymes in Paracoccus denitrificans
Microbiology, rok: 2003, ročník: 149, vydání: 12
-
Towards the Paracoccus denitrificans 2-DE protein database
Proteomic Forum, München 2003. International Meeting on Proteome Analysis. September 14-17, 2003, rok: 2003
2002
-
Analysis of membrane proteome of Paracoccus denitrificans by two-dimensional electrophoresis
XVIII. biochemický zjazd. Zborník., rok: 2002