Informace o projektu
Charakterizace MAGE proteinů: kofaktory E3 ubiquitin ligáz?
- Kód projektu
- IAA501630902
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat.
- Mgr. Sreenivas Reddy Bathula, Ph.D.
- Mgr. Lucie Bozděchová, Ph.D.
- Marc Guérineau, Ph.D., M.Sc.
- Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D.
- doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D.
- Mgr. Kateřina Zábrady, Ph.D.
- prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
- prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
- Spolupracující organizace
-
The University of Sussex
- Odpovědná osoba Prof. Alan R. Lehmann
Lidské buňky jsou schopné exprimovat 35 různých MAGE (Melanoma antigen) proteinů. MAGEG1-Nse1 heterodimer je součástí Smc5-6 komplexu, který se účastní opravy poškozené DNA. Kromě Nse1, který obsahuje RING-finger E3 ubiquitin ligasovou doménu, existují další dva příklady MAGE-RING finger interakcí. Pokus o predikci struktury MAGE homologní domény (MHD) naznačil její částečnou podobnost s doménou molekuly cullinu, který tvoří E3 ubiquitin ligasový komplex. V tomto projektu chceme ověřit hypotézu: "MAGE proteiny slouží jako kofaktory E3 RING ubiquitin ligás." Budeme mutovat konzervované aminokyselinové zbytky MAGEG1 proteinu tak, abychom zjistili, které z nich se podílí na interakci s Nse1. U specifických mutant budeme sledovat schopnost komplexu Smc5-6 učastnit se opravy DNA. Najdeme další RING finger proteiny a podrobíme je podobné analýze s cílem charakterizovat obecné interakční vlastnosti MAGE proteinů. Strukturu MHD budeme studovat pomocí NMR spektroskopie a difrakce krystalů.
Publikace
Počet publikací: 11
2015
-
The melanoma-associated antigen 1 (MAGEA1) protein stimulates the E3 ubiquitin-ligase activity of TRIM31 within a TRIM31-MAGEA1-NSE4 complex
Cell Cycle, rok: 2015, ročník: 14, vydání: 6, DOI
2013
-
Evolution and function of non-SMC subunits of SMC5/6 complex
Rok: 2013, druh: Konferenční abstrakty
2012
-
Analysis of the Nse3/MAGE-binding Domain of the Nse4/EID Family Proteins
PLoS One, rok: 2012, ročník: 7, vydání: 4, DOI
-
MAGE proteiny jako kofaktory buněčných procesů
XII. mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků z Čech a SLovenska, rok: 2012
2011
-
CHARACTERIZATION OF THE NSE4/EID BINDING TO NSE3/MAGE PROTEINS
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
Interactions between the Nse3 and Nse4 Components of the SMC5-6 Complex Identify Evolutionarily Conserved Interactions between MAGE and EID Families
PloS ONE, rok: 2011, ročník: 6, vydání: 2, DOI
2010
-
The MAGE and EID proteins affect transcription regulation of target genes
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
The Nse3/MAGE and Nse4/EID proteins are involved in transcription regulation
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
The NSE3/MAGE interactions with NSE4/EID proteins are evolutionarily conserved
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
2009
-
Architecture and activities of Structure Maintenance of Chromosome SMC5/6 complex
Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky