Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LC06030
- Období řešení
- 3/2006 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Centra základního výzkumu
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Klíčová slova
- léčiva proti rakovině, biosenzory, lektiny, počítačové modelování biomolekul, biomolekulární NMR
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Výsledky
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Publikace
Počet publikací: 290
2007
-
siRNA selection criteria – statistical analyses of applicability and significance
Biochemical and Biophysical Research Communications, rok: 2007, ročník: 359, vydání: 1
-
Spectroscopic and Theoretical Insights into Sequence Effects of Aminofluorene-Induced Conformational Heterogeneity and Nucleotide Excision Repair
Biochemistry, rok: 2007, ročník: 46/2007, vydání: 40
-
Structural basis of six bladed beta propeller lectins AAL and RSL
Materials and Structure in Chemistry, Biology,Physics and Technology, rok: 2007
-
Structure of Bombyx mori chemosensory protein 1 in solution
Archives of Insect Biochemistry and Physiology, rok: 2007, ročník: 66, vydání: 3
-
Study of structure, dynamics and local elasticity of 16S rRNA Helix 44 using molecular dynamics methods.
Journal Of Biomolecular Structure and Dynamics, rok: 2007
-
Study of unusual RNA structures using molecular dynamics methods
Workshop on Modelling interactions in Biomolecules III, rok: 2007
-
UNRAVELING THE PROBLEMS OF PROTEIN - SACCHARIDE INTERACTIONS VIA COMPUTATIONAL CHEMISTRY
Materials structure, rok: 2007, ročník: 14, vydání: 1
-
UPS AND DOWNS OF HOMOLOGOUS RECOMBINATION
Rok: 2007, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)
-
Utilizing Computational Chemistry for protein engineering - study of lectin-saccharide interactions
European Biophysics Journal 36 (suppl. 1), 6th EBSA Biophysics Congress, rok: 2007
-
X-ray Structures and Thermodynamics of the Interaction of PA-IIL from Pseudomonas aeruginosa with Disaccharide Derivatives
ChemMedChem, rok: 2007, ročník: 2, vydání: 9