Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LC06030
- Období řešení
- 3/2006 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Centra základního výzkumu
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Klíčová slova
- léčiva proti rakovině, biosenzory, lektiny, počítačové modelování biomolekul, biomolekulární NMR
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Výsledky
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Publikace
Počet publikací: 284
2013
-
CH-pi Interaction between Carbohydrates and Aromatic Moieties: Electron Density Issue
Rok: 2013, druh: Konferenční abstrakty
-
Toward Reproducing Sequence Trends in Phosphorus Chemical Shifts for Nucleic Acids by MD/DFT Calculations
Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2013, ročník: 9, vydání: 3, DOI
2012
-
Biotinylation of quantum dots for application in fluoroimmunoassays with biotin-avidin amplification
Microchimica Acta, rok: 2012, ročník: 176, vydání: 3-4, DOI
-
Dual roles of the SUMO-interacting motif in the regulation of Srs2 sumoylation.
Nucleic Acids Research, rok: 2012, ročník: 40, vydání: 16, DOI
-
Formamide-Based Prebiotic Synthesis of Nucleobases: A Kinetically Accessible Reaction Route
The Journal of Physical Chemistry A, rok: 2012, ročník: 116, vydání: 1, DOI
-
Free energy calculation in lectin/saccharide complexes
Rok: 2012, druh: Konferenční abstrakty
-
Homologous recombination and its regulation
Nucleic Acids Research, rok: 2012, ročník: 40, vydání: 13, DOI
-
Influence of stereochemistry on proton transfer in protonated tripeptide models
Journal of Molecular Modeling, rok: 2012, ročník: 18, vydání: 3, DOI
-
Is formamide nature’s choice to create life? Comment on the paper “Formamide and the origin of life” by Raffaele Saladino et al.
PHYSICS OF LIFE REVIEWS, rok: 2012, ročník: 9, vydání: 1, DOI
-
Molecular Dynamics Simulations of RNA Molecules
Innovations in Biomolecular Modeling and Simulations, vydání: 1. vydání, rok: 2012, počet stran: 27 s.