Informace o projektu
Struktura, funkce a regulace FerB, širokospecifické bakteriální oxidoreduktasy s možným významem pro ekotechnologii
- Kód projektu
- GA525/07/1069
- Období řešení
- 1/2007 - 12/2009
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Klíčová slova
- NAD(P)H:akceptor oxidoreduktasa, flavin, chroman, bioremediace, Paracoccus denitrificans
Enzym FerB z Paracoccus denitrificans byl původně objeven naší skupinou jako NAD(P)H závislá oxidoreduktasa schopná redukovat železité komplexy, chinony a chroman. Vzhledem k možnému využití FerB pro bioremediaci šestimocného chromu a snad i jiných těžkých kovů navrhujeme nyní systematický výzkum tohoto enzymu metodami obecné biochemie a strukturní a molekulární biologie. Gen kódující FerB bude amplifikován a klonován na základě známých 27 aminokyselinových zbytků na N-konci proteinu a již zveřejněné sekvence celého genomu P. denitrificans. Očekáváme, že heterologní exprese genu ferB poskytne velká množství čistého rekombinantního proteinu pro studie zaměřené na substrátovou specifitu, stechiometrii přenosu elektronů a redoxní kinetiku vázaného flavinového koenzymu. Budou také zahájeny pokusy o krystalizaci FerB a sběr difrakčních dat pro strukturní analýzu. Sebevražedné vektory a triparentální křížení poslouží k sestrojení mutantních kmenů bez FerB a reportérových kmenů nesoucích promotor ferB fuzovaný s genem pro β-galaktosidasu. Chování těchto kmenů za různých růstových podmínek by mělo poskytnout důležité poznatky o biologických funkcích FerB a regulaci jeho aktivity v buňce.
Publikace
Počet publikací: 8
2010
-
Crystallization and initial X-ray diffraction studies of the flavoenzyme NAD(P)H:(acceptor) oxidoreductase (FerB) from the soil bacterium Paracoccus denitrificans
Acta crystallographica. Section F Structural biology and crystallization communications, rok: 2010, ročník: F66, vydání: 4
-
Chromate reductase activity of the Paracoccus denitrificans ferric reductase B (FerB) protein and its physiological relevance
Archives of microbiology, rok: 2010, ročník: 192, vydání: 11
-
SOLVING PHASE PROBLEM USING A SE-MET DERIVATIVE OF THE FLAVOENZYME NAD(P)H:ACCEPTOR OXIDOREDUCTASE (FERB)
Materials Structure, vol. 17, no. 1a (2010), rok: 2010
2009
-
Ferric reductase A is essential for effective iron acquisition in Paracoccus denitrificans.
Microbiology-SGM, rok: 2009, ročník: 155, vydání: 4
-
Heterologous expression and molecular characterization of the NAD(P)H:acceptor oxidoreductase (FerB) of Paracoccus denitrificans
Protein Expression and Purification, rok: 2009, ročník: 68, vydání: 2
-
Characterization of the quinone reductase activity of the ferric reductase B protein from Paracoccus denitrificans
Archives of biochemistry and biophysics, rok: 2009, ročník: 483, vydání: 1
2008
-
FerA from Paracoccus denitrificans participates in iron utilization.
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
2007
-
Effect of ferB mutation on the sensitivity of Paracoccus denitrificans to quinones
FEBS Journal Supplement 32nd FEBS Congress Abstracts, rok: 2007