Informace o projektu
Studium molekulárních mechanismů biodegradačních reakcí - konstrukce QSBR modelů a proteinové inženýrství dehalogenas
- Kód projektu
- GA203/97/P149
- Období řešení
- 1/1998 - 1/2000
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Předkládaný projekt bude řešit problematiku biodegradace organických sloučenin mikroorganismy. Studovány budou základní mechanismy biodegradačních reakcí na molekulární úrovni. Praktické výstupy tohoto studia budou orientovány do oblasti předpovědi biodegradability sloučenin z jejich struktury (Quantitative Structure-Biodegradability Relationship, QSBR) a in-vitro modifikace biodegradačních enzymů. Konkrétně bude studována biodehalogenace halogenovaných alifatických uhlovodíků - sloučenin patřících mezi časté kontaminanty půd a podzemních vod. Výsledkem projektu budou matematické modely sloužící k předpovědím rychlosti degradace těchto sloučenin aerobními mikroorganismy, použitelné v environmentální analýze rizik. Dále budou s využitím molekulového modelování navrženy modifikace v enzymech haloalkan dehalogenasách vedoucí ke zlepšeným katalytickým vlastnostem těchto enzymů a jejich vyšší účinnosti při odbourávání haloalifatických sloučenin.
Publikace
Počet publikací: 15
2001
-
Reaction mechanism and stereochemistry of gamma-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA
Journal of Biological Chemistry, rok: 2001, ročník: 276, vydání: 11
-
TRITON: graphic software for rational engineering of enzymes
Trends in Biochemical Sciences, rok: 2001, ročník: 28, vydání: 1
2000
-
Dehalogenation of haloalkanes by Mycobacterium tuberculosis H37Rv and other mycobacteria
Applied and Environmental Microbiology, rok: 2000, ročník: 66, vydání: 1
-
Determination of haloalkane dehalogenase enzymatic activity by capillary zone electrophoresis
Book of Abstract "13th International symposium on high performance capillary electrophoresis and related techniques HPCE 2000"., rok: 2000
-
Determination of haloalkane dehalogenase enzymatic activity by capillary zone electrophoresis
Journal of Chromatography A, rok: 2000, ročník: 895, vydání: 1-2
-
Effect of the carbon source on assessment of degrading bacteria with the spread-plating technique during in situ bioremediation
Folia Microbiologica, rok: 2000, ročník: 45, vydání: 1
-
Rapid detection of haloalkane dehalogenase activity by capillary zone electrophoresis
Chemické Listy, rok: 2000, ročník: 94, vydání: 8
-
TRITON: in silico construction of protein mutants and prediction of their activities
Bioinformatics, rok: 2000, ročník: 16, vydání: 9
1999
-
Analysis of the reaction mechanism and substrate specificity of haloalkane dehalogenases by sequential and structural comparisons
Protein Engineering, rok: 1999, ročník: 12, vydání: 11
-
Construction and characterization of histidine-tagged haloalkane dehalogenase (LinB) of a new substrate class from a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium, Sphingomonas paucimobilis UT26
Protein Expression and Purification, rok: 1999, ročník: 17, vydání: 2