Projekt je zaměřen na komplexní řešení problematiky nozokomiálních infekcí, to jak z hlediska diagnostiky, tak terapie, a navazuje na předchozí výzkumné aktivity řešitele. Vedle typických původců nozokomiálních infekcí (pseudomonády, patogenní kvasinky, methicilin rezistentní S. aureus aj.) se bude projekt zabývat také za nízce patogenními agens, jako jsou koagulázanegativní stafylokoky a Cutibacterium acnes. Budou ověřovány nové identifikační a typizační postupy, zejména jde o optimalizaci molekulárně biologických metod a metod založených na Ramanově spektrometrii i hmotnostní spektrometrii, včetně vytváření knihoven charakteristických spekter. Počítá se i s využitím mikrofluidních přístupů. Pomocí těchto metod budou bude sledována přítomnost faktorů virulence a budou také hodnoceny vlivy zemního prostředí, zejména antibiotik, na tyto mikroby. Na základě získaných výsledků budou optimalizována diagnostická schémata a bude hodnocena úloha těchto agens na patogenezi onemocnění. Významnou částí projektu bude hledání nových preventivních a terapeutických přístupů, včetně využití bakteriofágů, antimikrobiálních peptidů aj.

Publikace