Informace o projektu
Struktura, biologie a medicínský potenciál ultra-krátké mimobuněčné DNA v krevní plasmě

Informace

Projekt nespadá pod Přírodovědeckou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.
Kód projektu
GF22-04242L
Období řešení
10/2022 - 9/2025
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut
Spolupracující organizace
Center for Molecular Medicine Cologne, University Hospital Cologne, University of Cologne

Fragments of DNA are constantly being released into the human blood circulation following cell death and by active secretion. The fragmentation of cell-free DNA (cfDNA) in blood plasma reflects its tissue of origin and mechanisms of release into the circulation. We established a novel method that enabled us to capture single-stranded ultra-short cfDNA (US cfDNA, ~50 nt) from blood plasma. We found that US cfDNA has its origin upstream of accessible transcription start sites. We observed that these sites are only enriched in US cfDNA when they contain the potential to adopt G-quadruplex and/or i-motif structures. Importantly, our data revealed that the US cfDNA fragments in healthy individuals are significantly more enriched in G4 sequences relative to cfDNA in cancer patients suggesting that US cfDNA have a specific role in cancer physiology. Although relationships of US cfDNA to disease is unknown, exploring alternative structural arrangements contained in ssDNA could improve our understanding of cfDNA biology leading to further opportunities to develop novel diagnostic strategies.

Cíle udržitelného rozvoje

Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.

Cíl udržitelného rozvoje č.  17 – Partnerství ke splnění cílů

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.