Informace o projektu
Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
- Kód projektu
- IAA401630901
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2013
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Hlavním cílem projektu je studium evoluce substrátové specifity mikrobiálních enzymů aktivních s xenobiotickými sloučeninami. Zvolený modelovým systém, halogenalkandehalogenasy, je vhodný k tomuto účelu vzhledem k aktivitě dehalogenas enzymů s biologicky špatně rozložitelnými sloučeninami, které se v biosféře nevyskytovaly před průmyslovou revolucí. Evoluce bude studována rekurzivně kvantitativním popisem substrátové specifity moderních halogenalkandehalogenas a srovnáním se specifitou předků těchto enzymů navržených fylogenetickou dedukcí a konstruovaných genovou syntézou. Konečným výsledkem této analýzy bude ohodnocení funkčního přesahu jednotlivých podrodin a podrobný popis molekulárních událostí vedoucích ke specializaci těchto enzumů umožňující účinný rozklad xenobiotických substrátů. Různé teoretické a experimentální přístupy budou použity k přípravě biologického materiálu a ke sběru dat nezbytných k testování alternativních evolučních hypotéz.
Publikace
Počet publikací: 67
2013
-
Are Time-Dependent Fluorescence Shifts at the Tunnel Mouth of Haloalkane Dehalogenase Enzymes Dependent on the Choice of the Chromophore?
Journal of Physical Chemistry B, rok: 2013, ročník: 117, vydání: 26, DOI
-
DspA from Strongylocentrotus purpuratus: the First Biochemically Characterized Haloalkane Dehalogenase of Non-Microbial Origin.
Biochimie, rok: 2013, ročník: 95, vydání: 11, DOI
-
E. coli deg31 upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty.
Rok: 2013
-
E. coli deg31-opt upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty.
Rok: 2013
-
E. coli deg90R upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty.
Rok: 2013
-
E. coli deg90R-opt upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty.
Rok: 2013
-
E. coli degWT upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty.
Rok: 2013
-
E. coli degWT-opt- upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty.
Rok: 2013
-
Expansion of Access Tunnels and Active-Site Cavities Influence Activity of Haloalkane Dehalogenases in Organic Cosolvents.
ChemBioChem, rok: 2013, ročník: 14, vydání: 7, DOI
-
Gates of Enzymes.
Chemical Reviews, rok: 2013, ročník: 113, vydání: 8, DOI