Informace o projektu
Česká národní infrastruktura pro biologická data
(ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2018131
- Období řešení
- 1/2020 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Ústav výpočetní techniky
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- RNDr. Matej Antol, Ph.D.
- Mgr. Adam Bodnár
- Ing. Radoslav Čerhák
- Mgr. Ivana Křenková
- Mgr. Slávek Licehammer
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- Mgr. Zdeněk Salvet
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Západočeská univerzita v Plzni
České vysoké učení technické v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves thirteen institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 48
2024
-
InVADo: Interactive Visual Analysis of Molecular Docking Data
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, rok: 2024, ročník: 30, vydání: 4, DOI
2023
-
Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning
ACS Catalysis, rok: 2023, ročník: 13, vydání: 19, DOI
-
Annotating Macromolecular Complexes in the Protein Data Bank: Improving the FAIRness of Structure Data
Scientific Data, rok: 2023, ročník: 10, vydání: 1, DOI
-
Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate
Molecular Neurodegeneration, rok: 2023, ročník: 18, vydání: 1, DOI
-
Evolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal
Preslia, rok: 2023, ročník: 95, vydání: 1, DOI
-
Fast satellite DNA evolution in Nothobranchius annual killifishes
Chromosome Research, rok: 2023, ročník: 31, vydání: 4, DOI
-
GERONIMO: A tool for systematic retrieval of structural RNAs in a broad evolutionary context
GigaScience, rok: 2023, ročník: 12, vydání: October 2023, DOI
-
In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning
Biotechnology Advances, rok: 2023, ročník: 66, vydání: September 2023, DOI
-
Proteases and their inhibitors involved in Schistosoma mansoni egg-host interaction revealed by comparative transcriptomics with Fasciola hepatica eggs
International Journal for Parasitology, rok: 2023, ročník: 53, vydání: 5-6, DOI
-
SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index
Similarity Search and Applications. SISAP 2023. Lecture Notes in Computer Science, vol 14289, rok: 2023