Informace o projektu
Molekulární stavba protein-DNA komplexů zapojených v opravě nukleotidových sestřihů
- Kód projektu
- GJ15-22380Y (kod CEP: GJ15-22380Y)
- Období řešení
- 1/2015 - 12/2017
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Juniorské granty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Současná úroveň studia protein-DNA komplexů, které koordinují odštěpení na 5'konci během procesu NER, kombinuje různé biochemické a strukturní nástroje. Naším cílem je detailní popis rozpoznání DNA křížení, katalytické funkce heterodimeru XPF/ERCC1 a pochopení kritické role XPA při karcinogenním poškození a modulaci aktivity XPF/ERCC1. Abychom mohly tyto jevy zkoumat, zavedeme multidisciplinární postup který se skládá z pokročilých metod NMR spektroskopie v roztoku, strukturní informace z měření rozptylu pod malým úhlem (SAXS) a inovativních postupů molekulového modelování. Tato studie poskytne nový mechanistický vhled do hlavního obranného systému proti UV záření a karcinogenům, velice podstatného pro lidské zdraví. Naše závěry a objevy napomůžou propojit recesivní mutace, funkce a související onemocnění a zároveň najít nové prostředky k modulaci NER funkce pro další terapeutické využití.
Publikace
Počet publikací: 4
2018
-
Analysis of binding interfaces of the human scaffold protein AXIN1 by peptide microarrays
Journal of Biological Chemistry, rok: 2018, ročník: 293, vydání: 42, DOI
-
Automated NMR resonance assignments and structure determination using a minimal set of 4D spectra
Nature Communications, rok: 2018, ročník: 9, vydání: JAN, DOI
-
Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain
Angewandte Chemie International Edition, rok: 2018, ročník: 57, vydání: 2, DOI
2016
-
A rapid method for detecting protein-nucleic acid interactions by protein induced fluorescence enhancement
Scientific Reports, rok: 2016, ročník: 6, vydání: December, DOI