Informace o projektu
Evoluce holocentrických chromosomů
(EvoHolo)
- Kód projektu
- GA13-29362S
- Období řešení
- 1/2013 - 12/2016
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Adaptivní vznik holocentrických chromosomu (bez lokalizované centromery) jako obrany proti centromerickému tahu bude testován pomocí selekcních režimu pusobících na geny kinetochorových proteinu. K objasnení prekvapive negativní korelace 2C/2n a znacné divergence velikostí a poctu holocentrických chromosomu je navržen nový evolucní mechanismus "holokinetický tah", který bude testován analýzou segregace fragmentovaných/nefragmentovaných homologu v potomstvu strukturálních heterozygotu pripravených rentgenovým zárením. Velikost genomu a genomický obsah GC, proporce a efektivita jednotlivých mechanismu karyotypové evoluce (aneuploidie, polyploidie, fúze/fragmentace chromosomu, proliferace/odstranování repetitivní DNA) budou analyzovány v holocentrických (Cyperaceae+Juncaceae, Chionographideae, Cuscuta subg. Cuscuta a Grammica, Drosera) a jejich sesterských monocentrických liniích pomocí prutokové cytometrie, pocítání chromosomu a nove vyvinutého fylogentického algoritmu. Bude vyvinuta nová detekcní technika pro masívní skríning holocentrismu u rostlin kombinující zárení a cytometrii.
Publikace
Počet publikací: 9
2017
-
Evolution of genome size and genomic GC content in carnivorous holokinetics (Droseraceae)
Annals of Botany, rok: 2017, ročník: 119, vydání: 1, DOI
2016
-
Absence of positive selection on CenH3 in Luzula suggests that holokinetic chromosomes may suppress centromere drive
Annals of Botany, rok: 2016, ročník: 118, vydání: 7, DOI
-
CenH3 evolution reflects meiotic symmetry as predicted by the centromere drive model
Scientific Reports, rok: 2016, ročník: 6, vydání: September, DOI
-
Flow cytometry may allow microscope-independent detection of holocentric chromosomes in plants
Scientific Reports, rok: 2016, ročník: 6, vydání: June, DOI
2014
-
Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, rok: 2014, ročník: 111, vydání: 39, DOI
-
Genome size and genomic GC content evolution in the miniature genome-sized family Lentibulariaceae
New Phytologist, rok: 2014, ročník: 203, vydání: 1, DOI
2013
-
Holokinetic Drive in the Karyotype Evolution of Monocots
Rok: 2013, druh: Konferenční abstrakty
-
Nutrient reserves may allow for genome size increase: evidence from comparison of geophytes and their sister non-geophytic relatives
Annals of Botany, rok: 2013, ročník: 112, vydání: 6, DOI
-
The Evolution of Genome Size and Base Composition in Cyperid Clade
Rok: 2013, druh: Vyžádané přednášky