Informace o projektu
Zavedení progresivních vysokorozlišovacích a cílených proteomických přístupů do výuky studentů biochemie
- Kód projektu
- FRVS/473/2013
- Období řešení
- 1/2013 - 12/2013
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Fond rozvoje vysokých škol
- G - Tvůrčí činnost studentů
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- Mgr. Iva Procházková, Ph.D.
- doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Monika Dvořáková, Ph.D.
Proteomika je nový vědní směr, který se zabývá identifikací a kvantifikací proteinů v různých biologických systémech a studiem jejich biologických funkcí. Předkládaný projekt pokrývá jednak oblast vysokorozlišovací necílené proteomiky zaměřené na co nejvyšší počet proteinů sledovaných v souvislosti se studovaným biologickým dějem, jednak oblast cílené proteomiky, zaměřené na studium biologické úlohy konkrétního proteinu. Pro necílenou proteomickou analýzu se uplatňují vysokorozlišovací metody využívající chromatografickou separaci peptidů on-line spojenou s hmotnostní spektrometrií (LC-MS), jíž obvykle předchází frakcionace peptidů na odlišném separačním principu. Cílem projektu je zavést tři vybrané frakcionační přístupy a rozšířit tak počet sledovaných proteinů v rámci konkrétních biologických projektů řešených na pracovišti. Jednou z aplikací cílené proteomiky je studium protein-proteinových interakcí vybraného proteinu. Zavedení metod metabolického značení proteinů pomocí aminokyselin se stabilními isotopy (SILAC) umožňuje překonat problém s falešně pozitivními identifikacemi protein-proteinových interakcí. Cílem této části projektu je zavést tyto progresivní techniky na pracovišti. Zpřístupnění zavedených metodik studentům v rámci diplomových, bakalářských a disertačních prací a demonstračních úloh ve vyučovaných předmětech umožní zkvalinit jejich vzdělávání v oblasti nejmodernějších biochemických přístupů.