Informace o projektu
Biofyzikální výzkum struktury, funkce a dynamiky biomolekul teoretickými i experimentálními přístupy
- Kód projektu
- MUNI/A/0968/2012
- Období řešení
- 1/2013 - 12/2013
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Masarykova univerzita
- Grantová agentura MU
- DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
- Mgr. Šimon Džatko, Ph.D.
- Mgr. Ing. Barbora Farkasová
- Mgr. Martina Fialová
- Mgr. Dušan Hemzal, Ph.D.
- Mgr. Tereza Chmelíková, Ph.D.
- Mgr. Miroslav Jurásek, Ph.D.
- Bc. Dominika Kasarová
- Mgr. Pavel Kohl
- Mgr. Michaela Krafčíková, Ph.D.
- Mgr. Magdaléna Krejčíková
- Mgr. Aneta Malá
- RNDr. Mgr. et Mgr. Arnošt Mládek, Ph.D.
- Mgr. Petra Řezníčková-Podloučková, Ph.D.
- RNDr. Jan Skalák, Ph.D.
- Mgr. Radim Skoupý
- Mgr. Bc. Lukáš Sukeník, Ph.D.
- Bc. Zuzana Svobodová
- Mgr. Karel Škubník, Ph.D.
- Mgr. Eva Štipčáková
- Mgr. Zuzana Trošanová, Ph.D.
- Mgr. Dušan Turek
- Mgr. Veronika Vargová, Ph.D.
- Mgr. Pavel Vašíček
- Mgr. Pavel Veverka, Ph.D.
- Mgr. Libor Vysloužil
- Mgr. Juraj Zajac
- Mgr. Ondřej Židek
Biofyzikální laboratoř Ústavu fyziky kondenzovaných látek (ÚFKL) PřF MU se orientuje na studium struktury, funkce a dynamiky biomolekul, zejména platinovaných DNA aduktů, molekulárně dynamické výpočty a kvantově chemickou analýzu RNA a proteinů. Na tomto výzkumu se vedle akademických pracovníků podílejí rovněž studenti bakalářských studijních oborů (Biofyzika, Lékařská fyzika), navazujících magisterských oborů (Aplikovaná biofyzika, Molekulární biofyzika) a postgraduální studenti doktorského programu Fyzika v oboru Biofyzika.
Cílem výzkumu je především pomocí nukleární magnetické rezonance (NMR) získat experimentální data na úrovni atomárního rozlišení a obdržet trojrozměrné struktury studovaných biomolekul (protein tubulin, tudor TDRD3, Nrd1 CID, Nab3) a platinované DNA adukty a kombinací experimentálních dat a výpočtů molekulové dynamiky pochopit vztah mezi strukturou a biologickou funkcí těchto biomolekul.
Vysoce kompetitivní základní výzkum, který je v biofyzikální laboratoři realizován by nebyl možný bez zapojení studentů, kteří v pregraduálních fázích studia získávají správné vědecké návyky a později již produkují vlastní vědecké výsledky. Postgraduální studenti jsou již plnohodnotnými členy výzkumného týmu přispívající svými poznatky ke směřování a řešení studovaných problémů jako je např. (i) studium velmi slabých interakcí mezi terminální doménou RNA polymerázy II a transkripčními faktory, (ii) interakce DNA dvojšroubovice s cisplatinovým derivátem druhé generace R,R-DACH, (iii) hledání optimálního vazebného partnera pro protein argonaut (Ago II) pomocí dokovacích algoritmů, (iv) studium struktury C-terminální domény proteiun Nab3.