Informace o projektu
Nové možnosti diagnostiky leukémie s využitím technologie DNA-mikročipů
- Kód projektu
- 1A8241
- Období řešení
- 7/2004 - 12/2006
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Zdraví obyvatel (Národní program výzkumu)
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- DNA microarrays;histone modifications;inhibitors of deacetylases;chromatin structure;leukemia;histon
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Jiří Mayer, CSc.
Bude studována exprese pomocí DNA microarrays u leukémií, vhodných kontrolních buněk a pro in vitro populace. Změny budou korelovány s epigenetickými charakteristikami chromatinu na úrovni jeho modifikací (metylace, acetylace histonů, metylace DNA). Strukturální charakteristiky chromatinu budou zkoumány v místech se změnami exprese pomocí fluorescenční in situ hybridizace, spektrální mikroskopie a imunoFISH. Budou testovány protinádorové látky s úzkým spektrem účinku na úrovni exprese. Využitím pokročilých metod vizualizace jaderných stuktur a moderní konfokální mikroskopie bude studován mechanismus vzniku a progrese leukémií. Cílem bude navrhnout vhodné markry pro diagnostiku. Domníváme se, že studium genů měnících expresi a epigenetických mechanismů stojících za těmito změnami nám umožní navrhnout cílové molekuly pro léčbu.
Publikace
Počet publikací: 19
2007
-
New insights into gene positional clustering and its properties supported by large-scale analysis of various differentiation pathways
Genomics, rok: 2007, ročník: 89, vydání: 1
2006
-
Comparative transcriptome maps: a new approach to the diagnosis of colorectal carcinoma patients using cDNA microarrays
Clinical Genetics, rok: 2006, ročník: 69, vydání: 3
-
Evaluation of CD34+ - and Lin- -selected cells from peripheral blood stem cell grafts of patients with lymphoma during differentiation in culture ex vivo using a cDNA microarray technique
Experimental hematology, rok: 2006, ročník: 34, vydání: 7
-
Localization of genetic elements of intact and derivative chromosome 11 and 22 territories in nuclei of Ewing sarcoma cells
Journal of Structural Biology, rok: 2006, ročník: 155, vydání: 3
-
Transcription density map as a new tool for evaluation of various expression profiles: Ex vivo differentiation of CD34+ cells
Rok: 2006, druh: Konferenční abstrakty
-
Vybrané aplikace technologie cDNA microarrays v onkologickém výzkumu
Klinická onkologie, rok: 2006, ročník: 19, vydání: 2
2005
-
Analýza obrazů získaných snímáním microarrays
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Aplikace FDR a FWER testovacích procedur na data ze studie kolorektálního karcinomu
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Combination of cDNA microarray technology and fluorescence leads to better understanding of relationships between gene expression and epigenetic regulation
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Důkaz klastrování genů na chromosomových doménách studiem diferenciací buněčných nádorových linií
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty