Informace o projektu
Struktura lidského genomu
- Kód projektu
- IAA5004306
- Období řešení
- 1/2003 - 12/2007
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- nuclear architecture; chromosome structure; FISH; high-resolution cytometry;
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
Po rozluštění genetického kódu je jedním z hlavních směrů výzkum lidského genomu studium jeho struktury vyššího řádu, které se stalo klíčem k pochopení nejdůležitějších buněčných procesů jako je diferenciace či transformace buňky. V tomto projektu bude systematicky zkoumána jaderná a teritoriální ropografie různých genetických elementů ve zdravých i nádorových buňkách s využitím cytometrie s vysokým rozlišením, vyvinuté v naší laboratoři. Topografie a její změny budou korelovány s lokální acetylací histonů, metylací DNA a expresí genových klastrů. Kromě toho budou studovány změny struktury chromosomových teritorií a buněčného jádra během diferenciace a kancerogeneze. Na základě získaných poznatků se budeme snažit o nalezení základních principů epigenetické regulace exprese genů. Praktickým cílem projektu bude využití získaných poznatků v diagnostice a při léčbě nádorových onemocnění.
Výsledky
Výsledkem by mělo být nalezení základních principů epigenetické regulace exprese genů. Praktickým cílem projektu bude využití získaných poznatků v diagnostice a při léčbě nádorových onemocnění.
Publikace
Počet publikací: 32
2009
-
H3K9 Acetylation and Radial Chromatin Positioning
Journal of cellular physiology, rok: 2009, ročník: 220, vydání: 1
2006
-
Comparative transcriptome maps: a new approach to the diagnosis of colorectal carcinoma patients using cDNA microarrays
Clinical Genetics, rok: 2006, ročník: 69, vydání: 3
-
Fast Point-Based 3D Alignment of Live Cells
IEEE Transactions on Image Processing, rok: 2006, ročník: 15, vydání: 8
-
Localization of genetic elements of intact and derivative chromosome 11 and 22 territories in nuclei of Ewing sarcoma cells
Journal of Structural Biology, rok: 2006, ročník: 155, vydání: 3
-
Statistical techniques for edge detection in histological images
First International Conference on Computer Vision Theory and Applications, rok: 2006
2005
-
Analysis of biomedical image data acquired using optical microscopy
Prague Post Genome Technology Workshop, rok: 2005
-
Analysis of biomedical image data acquired using optical microscopy
Proceedings of the 1st International Summer School on Computational Biology, rok: 2005
-
Analysis of biomedical image data acquired using optical microscopy
Rok: 2005, druh: Vyžádané přednášky
-
Nuclear levels and patterns of histone H3 modification and HP1 proteins after inhibition of histone deacetylases
Journal of Cell Science, rok: 2005, ročník: 118, vydání: 21
-
Sledování změn genové exprese u pacientů s kolorektálním karcinomem pomocí cDNA microarrays technologie a jejich diagnostika pomocí transkripčních map
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty