Mgr. Bc. Gabriela Bučeková

2025

• GROMACS MetaDump

  ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Software

  Rok: 2025

• Gromacs MetaDump: a tool for extracting GROMACS simulation metadata

  ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2025, ročník: 17, vydání: 1, DOI

• MOLEonline: a web-based tool for analysing channels, tunnels and pores (2025 update)

  RAČEK Tomáš VEĽKÝ Dušan BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana ŠPAČKOVÁ Anna BAZGIER Václav BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2025, ročník: 41, vydání: 9, DOI

• PDBCharges: Quantum-mechanical partial atomic charges for PDB structures

  BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej SVOBODA Tomáš ROŠINEC Adrián RAČEK Tomáš TICHÝ Dominik SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2025, druh: Konferenční abstrakty

• PDBCharges: Quantum-Mechanical Partial Atomic Charges for PDB Structures

  SCHINDLER Ondřej SVOBODA Tomáš ROŠINEC Adrián RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela TICHÝ Dominik BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2025, ročník: 53, vydání: W1, DOI

2024

• Rare ring conformations in PDB: Facts or wishful thinking?

  BUČEKOVÁ Gabriela DOSHCHENKO Viktoriia CHARESHNEU Aliaksei PORUBSKÁ Jana PAJTINKA Michal OLEKSIK Michal SVOBODA Tomáš HORSKÝ Vladimír SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

  Rok: 2024, druh: Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

2023

• Conformational study of small carbon rings in ligands

  BUČEKOVÁ Gabriela DOSHCHENKO Viktoriia HORSKÝ Vladimír SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• Invesigating the rare conformation of small rings in ligands

  BUČEKOVÁ Gabriela DOSHCHENKO Viktoriia HORSKÝ Vladimír SVOBODOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích

2022

• Validation of cycle conformation in small molecules

  BUČEKOVÁ Gabriela DOSHCHENKO Viktoriia CHARESHNEU Aliaksei SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty

2020

• Validation of cycle conformation in Protein Data Bank

  BUČEKOVÁ Gabriela PAJTINKA Michal SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty