Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.

2024

• Acceleration of Molecular Simulations by Parametric Time-Lagged tSNE Metadynamics

  HRADISKÁ Helena KUREČKA Martin BERÁNEK Jan TEDESCHI Guglielmo VIŠŇOVSKÝ Vladimír KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Článek v odborném periodiku

  The Journal of Physical Chemistry B, rok: 2024, DOI

• Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

  SLANINÁKOVÁ Terézia GREŠOVÁ Katarína PROCHÁZKA David SPIŠAKOVÁ Viktória ROŠINEC Adrián ČILLÍK Jakub ŠPRINGEROVÁ Pavlína KŘENEK Aleš DOHNAL Vlastislav SVOBODOVÁ Radka ANTOL Matej

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty

• Quantum Chemistry-Based Prediction of Electron Ionization Mass Spectra for Environmental Chemicals

  HECHT Helge ROJAS VERASTEGUI Wudmir Yudy AHMAD Zargham KŘENEK Aleš KLÁNOVÁ Jana PRICE Elliott James

  Článek v odborném periodiku

  Analytical chemistry, rok: 2024, ročník: 96, vydání: 33, DOI

2023

• A survey of the European Open Science Cloud services for expanding the capacity and capabilities of multidisciplinary scientific applications

  CALATRAVA Amanda ASOREY Hernán ASTALOS Jan AZEVEDO Alberto BENINCASA Francesco BLANQUER Ignacio BOBAK Martin BRASILEIRO Francisco CODÓ Laia CANO Laura del ESTEBAN Borja FERRET Meritxell HANDL Josef KERZENMACHER Tobias KOZLOV Valentin KŘENEK Aleš MARTINS Ricardo PAVESIO Manuel RUBIO-MONTERO Antonio Juan SÁNCHEZ-FERRERO Juan

  Článek v odborném periodiku

  COMPUTER SCIENCE REVIEW, rok: 2023, ročník: 49, DOI

• Cloudification of scientific experimental data using Onedata

  SVOBODA Tomáš KŘENEK Aleš OPIOŁA Łukasz MANZI Andrea HANDL Josef

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management

  ROŠINEC Adrián SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích

• Introduction to Onedata at CEITEC MU and in Czech National Repository Platform

  SVOBODA Tomáš SVOBODOVÁ Radka ANTOŠ David ROŠINEC Adrián KŘENEK Aleš

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích

• Onedata4Sci: Life-science experimental datasets management system

  ROŠINEC Adrián SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš HANDL Josef SABO Jozef KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• αCharges: partial atomic charges for AlphaFold structures in high quality

  SCHINDLER Ondřej BERKA Karel CANTARA Alessio KŘENEK Aleš TICHÝ Dominik RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2023, ročník: 51, vydání: W1, DOI

2022

• Automatic storing, sharing and archiving datasets with Onedata

  SVOBODA Tomáš KŘENEK Aleš HANDL Josef

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2022, druh: Další prezentace na konferencích