Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA

2023

• Atypical homodimerization revealed by the structure of the (S)-enantioselective haloalkane dehalogenase DmmarA from Mycobacterium marinum

  ŠNAJDAROVÁ Karolína MARQUES Sérgio Manuel DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Acta Crystallographica Section D: Structural Biology, rok: 2023, ročník: 79, vydání: November, DOI

• Catalytic mechanism for Renilla-type luciferases

  SMITH Andrea TOUL Martin PLUSKAL Daniel BAATALLAH Racha GAGNOT Glwadys RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SANTANA Vinicius T. T. STUCHLÁ Markéta NEUGEBAUER Petr CHAIYEN Pimchai DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David JANIN Yves L. L. PROKOP Zbyněk MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Nature Catalysis, rok: 2023, ročník: 6, vydání: 1, DOI

• Deciphering Enzyme Mechanisms with Engineered Ancestors and Substrate Analogues

  GAO Tadeja DAMBORSKÝ Jiří JANIN Yves L. MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  ChemCatChem, rok: 2023, ročník: 15, vydání: 19, DOI

• Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate

  NEMERGUT Michal MARQUES Sérgio Manuel UHRÍK Lukáš VÁŇOVÁ Tereza NEZVEDOVÁ Markéta GADARA Darshak Chandulal JHA Durga TULIS Jan NOVÁKOVÁ Veronika PLANAS IGLESIAS Joan KUNKA Antonín LEGRAND Anthony Thomas P HŘÍBKOVÁ Hana POSPÍŠILOVÁ Veronika SEDMÍK Jiří RAŠKA Jan PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří BOHAČIAKOVÁ Dáša SPÁČIL Zdeněk HERNYCHOVÁ Lenka BEDNÁŘ David MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Molecular Neurodegeneration, rok: 2023, ročník: 18, vydání: 1, DOI

• Illuminating the mechanism and allosteric behavior of NanoLuc luciferase

  NEMERGUT Michal PLUSKAL Daniel HORÁČKOVÁ Jana ŠUSTROVÁ Tereza TULIS Jan BÁRTA Tomáš BAATALLAH Racha GAGNOT Glwadys NOVÁKOVÁ Veronika MAJEROVÁ Marika SEDLÁČKOVÁ Karolina MARQUES Sérgio Manuel TOUL Martin DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk BEDNÁŘ David JANIN Yves L. MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Nature Communications, rok: 2023, ročník: 14, vydání: 1, DOI

• In cellulo and in vivo assays for compound testing against Trypanosoma cruzi

  GUERRA-SLOMPO Eloise Pavao PICCHI-CONSTANTE Gisele Fernanda Assine MAREK Martin ROMIER Christophe SIPPL Wolfgang ZANCHIN Nilson Ivo Tonin

  Článek v odborném periodiku

  STAR Protocols, rok: 2023, ročník: 4, vydání: 1, DOI

• Multimeric structure of a subfamily III haloalkane dehalogenase-like enzyme solved by combination of cryo-EM and x-ray crystallography

  CHMELOVÁ Klaudia GAO Tadeja POLÁK Martin SMITH Andrea CROLL Tristan I. SHAIKH Tanvir ŠKAŘUPOVÁ Jana CHALOUPKOVÁ Radka DIEDERICHS Kay READ Randy J. DAMBORSKÝ Jiří NOVÁČEK Jiří MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Protein Science, rok: 2023, ročník: 32, vydání: 10, DOI

• Study of Protein Conformational Dynamics Using Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry

  UHRIK Lukas HENEK Tomas PLANAS IGLESIAS Joan KUCERA Josef DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin HERNYCHOVA Lenka

  Kapitola v knize

  Advanced Methods in Structural Biology, rok: 2023, počet stran: 26 s.

2022

• Computer-aided engineering of staphylokinase toward enhanced affinity and selectivity for plasmin

  NIKITIN Dmitri MIČAN Jan TOUL Martin BEDNÁŘ David PEŠKOVÁ Michaela KITTOVÁ Patrícia THALEROVÁ Sandra VÍTEČEK Jan DAMBORSKÝ Jiří MIKULÍK Robert FLEISHMAN Sarel J. PROKOP Zbyněk MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2022, ročník: 20, vydání: May 2022, DOI

• Extended Mechanism of the Plasminogen Activator Staphylokinase Revealed by Global Kinetic Analysis: 1000-fold Higher Catalytic Activity than That of Clinically Used Alteplase

  TOUL Martin NIKITIN Dmitri MAREK Martin DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2022, ročník: 12, vydání: 7, DOI